MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015183	CGC	2	6	98143	98148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291537
2002	NC_015183	CGAG	2	8	98151	98158	25 %	0 %	50 %	25 %	325291537
2003	NC_015183	AGC	2	6	98182	98187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291537
2004	NC_015183	GGCGA	2	10	98314	98323	20 %	0 %	60 %	20 %	325291538
2005	NC_015183	CGG	2	6	98439	98444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291538
2006	NC_015183	T	6	6	98527	98532	0 %	100 %	0 %	0 %	325291538
2007	NC_015183	GTG	2	6	98605	98610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291538
2008	NC_015183	CCG	2	6	98621	98626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291538
2009	NC_015183	CGC	2	6	98678	98683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291538
2010	NC_015183	CGGG	2	8	98938	98945	0 %	0 %	75 %	25 %	325291539
2011	NC_015183	GC	3	6	98997	99002	0 %	0 %	50 %	50 %	325291539
2012	NC_015183	GCG	2	6	99021	99026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291539
2013	NC_015183	CGT	2	6	99052	99057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291539
2014	NC_015183	AG	3	6	99067	99072	50 %	0 %	50 %	0 %	325291539
2015	NC_015183	GATC	2	8	99076	99083	25 %	25 %	25 %	25 %	325291539
2016	NC_015183	CAG	2	6	99092	99097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291539
2017	NC_015183	CCG	3	9	99132	99140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291539
2018	NC_015183	GCG	2	6	99162	99167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291539
2019	NC_015183	CAT	2	6	99218	99223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291539
2020	NC_015183	ATG	2	6	99228	99233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291539
2021	NC_015183	TCG	2	6	99282	99287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291540
2022	NC_015183	CTCG	2	8	99305	99312	0 %	25 %	25 %	50 %	325291540
2023	NC_015183	GGC	2	6	99327	99332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291540
2024	NC_015183	CTG	2	6	99356	99361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291540
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2029	NC_015183	AG	3	6	99708	99713	50 %	0 %	50 %	0 %	325291540
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2034	NC_015183	GC	4	8	99888	99895	0 %	0 %	50 %	50 %	325291540
2035	NC_015183	GCC	2	6	99908	99913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291540
2036	NC_015183	GC	3	6	99922	99927	0 %	0 %	50 %	50 %	325291540
2037	NC_015183	GCC	2	6	99938	99943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291540
2038	NC_015183	GCGCC	2	10	99968	99977	0 %	0 %	40 %	60 %	325291540
2039	NC_015183	GGC	2	6	100001	100006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291540
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2042	NC_015183	CCG	2	6	100180	100185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291540
2043	NC_015183	GTGA	2	8	100217	100224	25 %	25 %	50 %	0 %	325291540
2044	NC_015183	ACG	3	9	100245	100253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291540
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2046	NC_015183	GCC	2	6	100296	100301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291540
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2050	NC_015183	CCG	2	6	100398	100403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291540
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2052	NC_015183	CCTT	2	8	100503	100510	0 %	50 %	0 %	50 %	325291540
2053	NC_015183	CGA	2	6	100534	100539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291540
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2056	NC_015183	CGG	2	6	100646	100651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291540
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2058	NC_015183	TCG	2	6	100707	100712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291540
2059	NC_015183	GC	3	6	100730	100735	0 %	0 %	50 %	50 %	325291540
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2062	NC_015183	GGC	2	6	100799	100804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291540
2063	NC_015183	CG	3	6	100932	100937	0 %	0 %	50 %	50 %	325291540
2064	NC_015183	GTC	2	6	100941	100946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291540
2065	NC_015183	TGG	2	6	101125	101130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291540
2066	NC_015183	TCGCC	2	10	101146	101155	0 %	20 %	20 %	60 %	325291540
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2068	NC_015183	CCGGC	2	10	101274	101283	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2069	NC_015183	GCT	2	6	101349	101354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2071	NC_015183	CAAGC	2	10	101440	101449	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2072	NC_015183	A	6	6	101454	101459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_015183	GGA	2	6	101485	101490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_015183	GAC	2	6	101513	101518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291541
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2076	NC_015183	CTGG	2	8	101596	101603	0 %	25 %	50 %	25 %	325291541
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2087	NC_015183	TGA	2	6	101897	101902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291541
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2089	NC_015183	CTG	2	6	101950	101955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291542
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2097	NC_015183	TGA	2	6	102458	102463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291542
2098	NC_015183	CGAT	2	8	102464	102471	25 %	25 %	25 %	25 %	325291542
2099	NC_015183	GC	3	6	102503	102508	0 %	0 %	50 %	50 %	325291542
2100	NC_015183	GAA	2	6	102595	102600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291542
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2102	NC_015183	CT	3	6	102689	102694	0 %	50 %	0 %	50 %	325291542
2103	NC_015183	GGA	2	6	102726	102731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291542
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2105	NC_015183	CGCAT	2	10	102899	102908	20 %	20 %	20 %	40 %	325291543
2106	NC_015183	AAG	2	6	102947	102952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291543
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2109	NC_015183	GCC	2	6	103112	103117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291543
2110	NC_015183	CG	3	6	103206	103211	0 %	0 %	50 %	50 %	325291543
2111	NC_015183	TGT	2	6	103233	103238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291543
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2118	NC_015183	GAT	2	6	103516	103521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291543
2119	NC_015183	GCA	2	6	103539	103544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291543
2120	NC_015183	GAT	2	6	103545	103550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291543
2121	NC_015183	GCG	2	6	103811	103816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291544
2122	NC_015183	GC	4	8	103877	103884	0 %	0 %	50 %	50 %	325291544
2123	NC_015183	GCG	2	6	103948	103953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291544
2124	NC_015183	TGA	2	6	103978	103983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291544
2125	NC_015183	CG	3	6	104013	104018	0 %	0 %	50 %	50 %	325291544
2126	NC_015183	GC	4	8	104030	104037	0 %	0 %	50 %	50 %	325291544
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2370	NC_015183	CCA	3	9	115013	115021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291553
2371	NC_015183	GTC	2	6	115032	115037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291553
2372	NC_015183	CGG	2	6	115073	115078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291553
2373	NC_015183	CTT	2	6	115126	115131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291553
2374	NC_015183	CCG	2	6	115133	115138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291553
2375	NC_015183	CAT	2	6	115314	115319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291553
2376	NC_015183	CG	3	6	115362	115367	0 %	0 %	50 %	50 %	325291553
2377	NC_015183	AT	3	6	115383	115388	50 %	50 %	0 %	0 %	325291553
2378	NC_015183	GCC	2	6	115484	115489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291553
2379	NC_015183	GC	3	6	115490	115495	0 %	0 %	50 %	50 %	325291553
2380	NC_015183	CTC	2	6	115512	115517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291553
2381	NC_015183	TCG	2	6	115593	115598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291553
2382	NC_015183	TGC	3	9	115652	115660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291553
2383	NC_015183	TCG	2	6	115721	115726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291553
2384	NC_015183	CG	3	6	115792	115797	0 %	0 %	50 %	50 %	325291553
2385	NC_015183	TGCG	2	8	115868	115875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2386	NC_015183	GCCA	2	8	115955	115962	25 %	0 %	25 %	50 %	325291554
2387	NC_015183	GCC	2	6	115969	115974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291554
2388	NC_015183	CGC	2	6	115988	115993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291554
2389	NC_015183	ATC	2	6	116078	116083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291554
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2391	NC_015183	GCCT	2	8	116283	116290	0 %	25 %	25 %	50 %	325291554
2392	NC_015183	CCG	2	6	116349	116354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291554
2393	NC_015183	GAC	2	6	116357	116362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291554
2394	NC_015183	TGCC	2	8	116483	116490	0 %	25 %	25 %	50 %	325291554
2395	NC_015183	TGCG	2	8	116529	116536	0 %	25 %	50 %	25 %	325291554
2396	NC_015183	GC	4	8	116557	116564	0 %	0 %	50 %	50 %	325291554
2397	NC_015183	GCC	2	6	116650	116655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2398	NC_015183	GCA	2	6	116664	116669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2399	NC_015183	A	6	6	116685	116690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2400	NC_015183	GC	3	6	116732	116737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2401	NC_015183	GTT	2	6	116792	116797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2402	NC_015183	CGC	2	6	116799	116804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2403	NC_015183	GTAT	2	8	116962	116969	25 %	50 %	25 %	0 %	325291555
2404	NC_015183	GTC	2	6	116974	116979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291555
2405	NC_015183	AAT	2	6	117018	117023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2406	NC_015183	T	7	7	117053	117059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2407	NC_015183	GCT	2	6	117076	117081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2408	NC_015183	T	6	6	117081	117086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2409	NC_015183	CTC	2	6	117110	117115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2410	NC_015183	GGGGA	2	10	117155	117164	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2411	NC_015183	GCT	2	6	117197	117202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291556
2412	NC_015183	GCCTCG	2	12	117205	117216	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325291556
2413	NC_015183	CAT	2	6	117245	117250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291556
2414	NC_015183	CAC	2	6	117290	117295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291556
2415	NC_015183	ACG	2	6	117370	117375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291556
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2417	NC_015183	GC	3	6	117422	117427	0 %	0 %	50 %	50 %	325291556
2418	NC_015183	ATCT	2	8	117432	117439	25 %	50 %	0 %	25 %	325291556
2419	NC_015183	TCC	2	6	117465	117470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291556
2420	NC_015183	CAT	2	6	117479	117484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291556
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2422	NC_015183	ATG	2	6	117520	117525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291556
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2428	NC_015183	CGT	2	6	117721	117726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291556
2429	NC_015183	CAT	2	6	117770	117775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291556
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2431	NC_015183	GC	3	6	117840	117845	0 %	0 %	50 %	50 %	325291556
2432	NC_015183	TCA	2	6	117917	117922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291556
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2435	NC_015183	CTCA	2	8	118025	118032	25 %	25 %	0 %	50 %	325291556
2436	NC_015183	GAT	2	6	118052	118057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291556
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2440	NC_015183	CGG	2	6	118116	118121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291556
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2448	NC_015183	CAG	2	6	118475	118480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291556
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2450	NC_015183	GCC	2	6	118584	118589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291556
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2452	NC_015183	GCA	2	6	118655	118660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291556
2453	NC_015183	CAT	2	6	118673	118678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291556
2454	NC_015183	GCC	2	6	118686	118691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291556
2455	NC_015183	TCG	2	6	118715	118720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291556
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2464	NC_015183	GCA	2	6	118962	118967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291556
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2466	NC_015183	TTGA	2	8	119015	119022	25 %	50 %	25 %	0 %	325291557
2467	NC_015183	GAG	2	6	119027	119032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291557
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2470	NC_015183	GCT	2	6	119185	119190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291557
2471	NC_015183	TGA	2	6	119232	119237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291557
2472	NC_015183	CAT	2	6	119332	119337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291557
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2479	NC_015183	CGG	2	6	119704	119709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291557
2480	NC_015183	CCA	2	6	119841	119846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291557
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2482	NC_015183	CGA	2	6	119919	119924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291557
2483	NC_015183	CGCAG	2	10	119943	119952	20 %	0 %	40 %	40 %	325291557
2484	NC_015183	GCT	2	6	119965	119970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291557
2485	NC_015183	GCT	2	6	119993	119998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291557
2486	NC_015183	GCA	2	6	120031	120036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291557
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2488	NC_015183	GGC	2	6	120169	120174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291557
2489	NC_015183	CGC	2	6	120190	120195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291557
2490	NC_015183	A	6	6	120201	120206	100 %	0 %	0 %	0 %	325291557
2491	NC_015183	GC	4	8	120215	120222	0 %	0 %	50 %	50 %	325291557
2492	NC_015183	CGC	2	6	120226	120231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291557
2493	NC_015183	CGG	2	6	120235	120240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291557
2494	NC_015183	A	6	6	120294	120299	100 %	0 %	0 %	0 %	325291557
2495	NC_015183	TGC	2	6	120392	120397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291558
2496	NC_015183	ATG	2	6	120400	120405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291558
2497	NC_015183	GC	3	6	120415	120420	0 %	0 %	50 %	50 %	325291558
2498	NC_015183	CCG	2	6	120433	120438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291558
2499	NC_015183	GGA	2	6	120487	120492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291558
2500	NC_015183	GGA	2	6	120528	120533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291558

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